龜馱碑的故事起源于陳宣帝年間,當時北方為北周,北周武帝滅佛時,齊地海曲慧聞禪師被迫從海上南下,遇到大風浪,船沉海底。這時有一只神龜將慧聞等人駝到江寧(現在的南京)?;勐勏蛏颀數乐x時,神龜說:"師父不認識我了,我就是海曲(今日照)石梁溪放生池里的老龜。這時慧聞才恍然大悟。原來慧聞在海曲曾買下石梁溪作為放生池。后來慧聞將這個故事講給陳宣帝聽,陳宣帝很感動,就下詔建報恩寺,并為此立碑。石碑由龜背負,既是對神龜報恩的詮釋,也取其天長地久之意。
現如今人們建造龜馱碑主要因為以下四點:
一是因龜體矮背大,有足夠的承載量,用其所長;
二是龜喻長壽,取其生命長久的屬性,寓意所載事跡永遠流傳,符合萬古流芳之意;
三是龜自古以來就與龍、鳳、麒麟并稱四靈;
四是龜習文,龜自古就與文字有關,如甲骨文等。